-sejtjei ellen irányuló autoimmun folyamat

A DMT1 és a HLA kapcsolatának szoros összefüggésére magyarázatot adhat, hogy a HLA komplex polimorfizmusainak következtében az MHCII osztály komplex fekárjék rendellenes struktúrát vesznek fel. Ezáltal képesek a T-sejtek számára egy specifikus pancreas antigént prezentálni (glutamin-sav dekarboxiláz), így az autoimmun választ előidézni. Ezen kívül a szoros HLA asszociációra magyarázatot adhat az is, hogy a thymusban a T-sejt populációk érése nagyban függ a MHCII DQ allélektől. Ezen allélek polimorfizmusainak additív hatására olyan T-sejt populációk képződnek, amelyek a pancreas -sejtjei ellen irányuló autóimmun reakciók elindítását eredményezik.