Southern blot vizsgálat

A mérés során a DNS-t NaOH-val denaturálják, így a DNS két szála elválik egymástól. Ezt követően a gél tetejére nitrocellulóz vagy nylon membránt és több rétegben szűrőpapirt helyeznek. A szűrőpapir kapillárishatása miatt a minták felfelé mozdulnak és a gélbeli pozíciójának megfelelően rákötődnek a membránra. Ezt követően a DNS-membrán kovalens keresztkötése történik (nitrocellulóz membrán - száraz hőkezelés (60-100°C), nylonmembrán - UV kezelés). Majd a membránra a vizgsálandó DNS szakasszal komplementer specifikus hibridizációs próbát visznek. A próba jelölése lehet radioaktívan, fluoreszcensen, vagy kromogenikus festékkel.

A hibridizációt követően, a membránt Röntgen-filmen autoradiográfiával, fluorescens jelölés esetén fluorométerrel, vagy a kromogén szubsztát alkalmazásával enzimatikus színreakcióval teszik láthatóvá.